自己破産で仕事道具も持っていかれるのでしょうか？

差押禁止動産として自由財産の対象となりえます。

仕事用の道具の種類によりますが、差押禁止動産として自由財産の対象となりえます。そうでなくても、仕事に必要なものとして自由財産の拡張の申し立てにより財団から除くことは可能です。車も同様ですが、場合によっては認められないこともありますが、管財人に任意売却してもらうということも出来ます。